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发表于 2015-1-27 15:09 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
从NCBI的GenBank数据库中找到Accession number为 “序列Acc#【每人1个,见另附Excel表】”  的序列,然后进行如下研究:
1)说明该序列的基本特征(该数据库记录的各字段信息);
2)根据它的编码序列,找到它所编码的多肽序列及其Acesssion Number;以下的研究内容都基于该多肽序列。
3)分析该多肽序列的结构,指出它所包含的结构域;
4)从数据库中找出10条以上该序列的同源序列,其中要求必须包括并指出除其来源生物所属科之外的3种以上已经全基因组测序的其它模式生物中的同源序列。利用Clustal X或Clustal W或功能相当的软件作出这些序列的系统进化树,并注明每种生物所属的类群。
5)从上题中的3种模式生物中同源序列中任选1条,找到编码该序列的基因,列出该基因的结构(基因组DNA序列,mRNA序列,如有不同的基因模型则需一一列出,标示出其内含子与外显子,5’与3’UTR区等);
6)利用Cn3D显示出其可能的三维结构图;
7)利用GO数据库对该库列进行注释;
8)找出该基因的表达模式,如果存在相应支持数据,需包括它的发育时间表达模式、组织器官表达模式和亚细胞定位模式;
9)预测该多肽的翻译后修饰类型及位点。
序列为AK118814.1
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