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生化问题求赐教

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发表于 2011-9-23 20:48 | 只看该作者 回帖奖励 |倒序浏览 |阅读模式
是2011年中科院的考题。
1、一个50K的蛋白质用DTT处理后用SDS-PAGE处理,分子量变为25K,是什么原因?

2、DNA为什么保存在盐溶液中。

求高人详细解答一下{:soso_e121:}

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    发表于 2011-9-24 20:53 | 只看该作者
    第一个问题是因为这个蛋白是同源二聚体,由二硫键连接的;第二个问题就比较难办了,dna不一定要保存在盐溶液里啊,只不过DNA高盐浓度溶解低盐析出而已,个人是这么认为的,我们实验室提出的质粒 DNA啥的一般用双氧水保存的。

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    发表于 2011-10-11 00:30 | 只看该作者
    本帖最后由 omegalong 于 2011-10-11 00:38 编辑

    这个是搜来的,第2题的答案,个人认为很有道理,也不知道你看到没,总之发上来看看。

           DNA存在纯水中没有在盐溶液中稳定,保存的时间不够长,易降解;但保存在盐溶液中对于后续的有些实验会有影响。短期用一般保存在纯水中。
           DNA在纯水中易变性原因:每一个核苷酸的磷酸基上都带有一个负电荷。如果这些负电荷没有被中和,双链之间的这种强有力的静电排斥作用将驱使两条链分开(在同一条链内虽然也存在着这种静电斥力,但由于链内的共价键,这种静电斥力并不重要)。但是当有盐类加入时,这些带负电荷的磷酸基团可以被正离子(如Na+)所中和,也就是正离子围绕在磷酸基周围形成了"离子云",有效地屏蔽了磷酸基之间的静电斥力。这就是Debye-Hvckel 离子屏蔽理论。
           在生理盐浓度(约0.2mol/L)时就发生了这种屏蔽作用。斥力也被中止。当离子浓度降低时,这种屏蔽作用减弱,斥力增大,因而Tm值随之降低。事实上,纯蒸馏水中的DNA在室温下就会变性,也就是这个缘故,所以还需保存在-20℃延缓变性。在超过生理盐浓度时,Tm值仍然随着离子强度的增加而上升,这是因为在高盐浓度下碱基的溶解性降低而增加了疏水作用力,促进了双螺旋结构的稳定。

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    发表于 2012-12-31 23:44 | 只看该作者
    1、一个50K的蛋白质用DTT处理后用SDS-PAGE处理,分子量变为25K,是什么原因?
    答:SDS会引起蛋白质变性,使得蛋白质的亚基解离为单个亚基;DTT是二硫苏糖醇,会还原S-S为巯基,进而拆开二硫键的链接:(1)拆开不同肽链之间的二硫键链接,使得二硫键链接的肽链断裂,(2)DTT也还原链内二硫键使得蛋白质的空间结构松弛。
    所以本题有两种可能性:其一,50K的蛋白质,由两个25K的亚基构成,SDS处理后,成为两个25K的亚基,SDS-PAGE测定的是两个25K的亚基的相对分子量。此时DTT处理50K的蛋白质有助于打开亚基内部的二硫键,使亚基更易被SDS变性。
    第二种可能性:50K的蛋白质由两个25K的肽链构成,而且两条肽链之间由二硫键共价链接,而不是由次级键链接,DTT是二硫苏糖醇,会还原S-S为巯基,进而拆开二硫键的链接,使50K的蛋白质之成为两个25K的独立的肽链,这样SDS-PAGE测定的是两个25K的立的肽链的相对分子量。

    2、DNA为什么保存在盐溶液中。
    答:DNA有负电荷,需要正离子中和,以便降低彼此斥力,楼上答得很好,我不用在费口舌了。

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