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军事医学科学院院系设置我院所属16个单位主要工作、优势与特色
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1．卫生勤务与医学情报研究所（北京）
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主要从事卫生事业管理与医学情报研究，在卫生勤务、医学情报、药学情报、医药卫生科技发展战略、信息技术、编辑出版等研究领域具有优势，并积极开展生物医药咨询，拥有的万亿次超级刀片计算机可进行生物信息学、生物计算等方面的研究。
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2．放射与辐射医学研究所(北京)
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主要从事辐射损伤和有关疾病的防诊治研究，在急性放射病防诊治、核与辐射事件医学应急处置、放射毒理和辐射危害评价、基因组与蛋白质组学、细胞增殖与分化调控、生物芯片、抗病毒和抗肿瘤药物、药物代谢、新药临床前安全性评价及激光生物学等方面形成优势，近年积极拓展研究领域，逐步深入开展了生物信息学、免疫系统损伤和修复、脑损伤和脑保护及非电离辐射生物效应研究。先后有3名专家当选两院院士，他们是中国工程院院士吴德昌、中国科学院院士吴祖泽、贺福初。
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3．基础医学研究所(北京)
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主要从事与军事医学和临床医学相关的基础医学研究，在神经损伤与修复、造血调控和造血干细胞治疗、移植免疫与免疫调节机制研究和基因工程药物、疫苗和诊断试剂研究等方面具有优势。同时正积极开展细胞工程、生物文库和生物信息学等方面的研究。拥有中国工程院院士1名：沈倍奋。
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4．卫生学环境医学研究所（天津）
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主要从事在劳动卫生、环境卫生、营养卫生、高原与寒带卫生、应激与适应及卫生检验等研究领域形成优势和特色。
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5．微生物流行病研究所(北京)
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主要从事部队常见传染病防治研究。其细菌学、病毒学、感染免疫、分子流行病、流行病防治、媒介生物学及其防治和抗疟药研究等具有较高水平。
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6．毒物药物研究所(北京)
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主要从事化学毒物损伤医学防护新药研发及其相关的基础和关键技术研究，在药理学、毒理学、实验病理学、药物合成、代谢、制剂、植物化学、中药现代化、毒物检测等领域学科配套具有明显综合优势特色和较高水平，能够完成创新药物的设计、合成、临床前安全性评价等一整套研究。先后有2名专家当选两院院士，他们是：中国工程院院士秦伯益、中国科学院院士孙曼霁。
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7．卫生装备研究所（天津）
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主要从事军队卫生装备研究，在卫生装备总体论证，急救医疗器械，野战机动医疗平台、卫生技术车辆等方面形成特色，在机械工程、人机工程，智能控制，组织工程、生物力学，膜分离与水处理技术，生物和高分子材料等方面具有学科优势。
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8．生物工程研究所(北京)
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主要从事生物高技术基础与应用研究，在基因工程疫苗、药物和诊断试剂、微生物基因组学、蛋白质结构模建和分子设计、微生物工程、细胞工程、抗体工程、发育生物学、肿瘤分子生物学、转基因动物和生物信息学等研究方面具有较强优势。拥有中国工程院院士1名：黄翠芬。
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9．野战输血研究所(北京)
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建于1997年，是中国人民解放军血液监督检定中心，主要从事输血医学研究，在输血相关传染病的诊断与治疗、血源病毒灭活、血源性致病微生物快速检测、创伤止血、血液与器官保存、血液代用品、血型转换、异种器官移植和干细胞与再生医学等形成优势学科。
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10．疾病预防控制所(北京)
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是全军疾病预防控制中心的主体部分，主要从事军队卫生监督监测及疾病预防控制，在预防医学及分子生物学研究方面具有优势和特色。
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11．军事兽医研究所（长春）
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是全军唯一的兽医科学研究机构，在病毒学、细菌学、媒介昆虫与流行病学、动物性食品安全和兽医药理毒理等研究领域达到了国内领先水平。拥有兽医学博士后科研流动站、全军基因工程重点实验室和预防兽医学国家重点学科。现有中国工程院院士1名：夏咸柱。
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12．附属医院(北京)
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三级甲等医院。是收治以肿瘤、恶性血液病、化学中毒和放射病病人为主要专科的综合性医院。展开床位510张，拥有5个全国、全军专科中心，年门诊量20余万人次。在肿瘤、血液病、中毒救治与造血干细胞移植等方面的临床治疗居全国全军领先水平。
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13.国家生物医学分析中心(北京)
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是国家科技部正式批准成立的国家级中心，并被列入全国十大技术平台进行重点建设。在药物与毒物分析、肿瘤细胞生长与调控、蛋白质结构与功能、代谢组学以及特殊环境分析方面，具有强大的科研实力，具备最先进的科研条件、严谨与创新的科研氛围以及高水平的科研团队。
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14. 医学图书馆(北京)
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是全军最大的专业图书馆，是国家级生物医学图书馆中心馆组的重要成员。现有馆藏100余万册，每年订购外文期刊4000余种、中文期刊8000余种，文献数据库近30种。有800个座位的开放式科技书库和社科书库和先进的电子阅览室和互联网机读厅。建有全军医学图书信息资源共享网络，是全军远程医学信息网资源服务站点。
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15．实验仪器厂(北京)
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主要从事智能化仪器的研制和科研仪器设备的计量、维修等工作。现已发展成为以生物医学工程、电子信息技术、机械设计、计算机技术、制冷与低温工程以及医学计量为主的专业技术保障单位。
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16．实验动物中心(北京)
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作为全军医学实验动物研究中心、质量检测机构，是国内学科设置最为齐全的实验动物专业单位。具有国内一流的实验动物生产繁育设施和科研条件。
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重点实验室
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军事医学科学院拥有国家生物医学分析中心、蛋白质组蛋白质药物（国家）工程研究中心、国家生物防护装备工程技术研究中心、国家新药临床前安全性评价中心、国家临床药理基地、国家药物代谢技术平台、全军疾病预防控制中心、全军预防医学研究中心、全军核事故医学应急救援中心、全军卫生监测中心、全军化学毒物检测研究中心、全军实验血液学实验室、全军分子免疫实验室、全军基因组学与蛋白质组学、全军军事应激医学等30多个跨学科综合性研究中心和重点专业实验室。
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重点学科
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病理学与病理生理学、药理学、生物化学与分子生物学为国家重点学科
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可授予的学位
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经国家批准，军事医学科学院在医学、理学、农学、工学、管理学等五个学科门类中授予硕士和博士学位。
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现有生物学、基础医学、药学、公共卫生与预防医学、兽医学5个一级博士学位授权点。
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目前招收博士研究生的学科专业24个，分别是微生物学、遗传学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学、放射医学、流行病与卫生统计学、劳动卫生与环境卫生学、营养与食品卫生学、卫生毒理学、军事预防医学、基础兽医学、预防兽医学、药物化学、药剂学、药物分析学、微生物与生化药学、药理学、生物信息学、生物安全、再生医学、卫生防护防疫技术与装备。
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招收硕士研究生的学科专业31个，分别是微生物学、遗传学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学、放射医学、流行病与卫生统计学、劳动卫生与环境卫生学、营养与食品卫生学、卫生毒理学、军事预防医学、药物化学、药剂学、药物分析学、微生物与生化药学、药理学、生物医学工程、基础兽医学、预防兽医学、内科学、肿瘤学、情报学、辐射防护及环境保护、生物信息学、生物安全、再生医学、卫生防护防疫技术与装备、后方专业勤务、军事装备学。
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现有药学、基础医学、公共卫生与预防医学、生物学、兽医学5个博士后流动站。
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截止2005年，先后为2263名毕业研究生和在职人员授予学位，其中博士学位696名，硕士学位1567名。
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师资力量
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我院有教研室34个，其中专职教研室2个，兼职教研室32个，可承担66门硕士研究生课程和7门博士研究生公共课程。全院每年承担研究生课程教学的科技人员有450名左右，并聘有外籍教师任教。可以承担全院硕士、博士研究生的大部分基础和专业课程教学任务。
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学生人数
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自1978年恢复研究生招生工作以来，军事医学科学院共招收研究生总数达3507名，其中硕士研究生2236名，博士研究生1271名。现在学人数共计1154名。
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